有一年饶州地方旱情严重，州守洪皓发文并派员视察所属各县，减免田地租税。黄瑀为所行县请求十之免九，而其他县份只告减轻一成。洪浩大惑不解，过后派员巡视各县，唯独黄瑀所行县份没有流民现象。洪皓称赞黄瑀所为，极力向上推荐，于是黄瑀调湖北转运司主管账司。后改知永春，四时勤于指导农事，遇旱为民祈雨，颇有政事(参见《永春县志·乐山祈雨》)。迁两浙转运司干办公事时，有人提议“鬻公田”，转运使派黄瑀视察。黄瑀到各郡县了解情况，稔熟知其间存在多寡轻重不均之弊，又考虑鬻公田一时所获不过数年租赋，自后难免横征暴敛，加重耕者负担，不便施行，从而保住了公田。又有贵将杨存中请地扩建兵营，黄瑀经查勘，根据营卒人数计算，所请之地大过实际需要数倍，要毁坏许多民田庐家，况且所建是供权贵们享乐的观游建筑，于是没有满足杨存中的占地要求。

权知秀州华亭县(今浙江嘉兴)时，遇大饥年，他指示常平仓粮官开仓赈济，粮官说：“当俟奏报。”黄瑀说：“民命在朝夕，苟可以生之，虽重得罪不悔。”立即发放常平仓粮食济饥，全活百姓数以万计。吏部侍郎汪应辰、侍御史汪澈极力推荐黄瑀才能，遂升御史台检法官。不久改任江南东路提点刑狱，徙转运副使，视事旬日，改知漳州。乞祠主管台州崇道观。乾道二年(1168)逝世。黄瑀刚直，清廉爱民，生平清苦自励。然而周济贫穷、赈救饥乏，必竭其力，死后家无余财。祀郡乡贤祠。子杲、东、黄榦均见民国《长乐县志·儒林》。